乔基姆·安德森15岁时从哥本哈根青训营转投米迪兰特青训营，2013年通过试训后加入特温特青训，俱乐部给他提供的计划为让他先在青年队效力6个月以适应荷兰的环境，然后再正式升入一线队。

　　俱乐部

　　2013年11月8日，乔基姆·安德森被提拔至一线队，但并没有为特温特一线队出战任何比赛，第二个赛季获得了与一线队球员一起训练的许可。2015年3月7日，在特温特与威廉二世的比赛中，乔基姆·安德森替补登场完成了一线队首秀。一周后，他与特温特续约至2018年。2015–16赛季中，他逐渐成为一线队的主力球员。

　　2017年8月26日，乔基姆·安德森与意甲球队桑普多利亚签约。2018年2月25日，在桑普多利亚与乌迪内斯的比赛中，安德森完成了首秀。2018年11月8日，桑普多利亚与乔基姆·安德森续约至2022年夏天。

　　2019年7月12日，乔基姆·安德森与法甲球队里昂签约5年。10月2日，在里昂与莱比锡红牛的比赛中，乔基姆·安德森完成了个人欧冠首秀，11月11日，在里昂3-1击败本菲卡的比赛中，乔基姆·安德森打进了自己的首粒欧冠进球。

　　2020年10月5日，里昂中后卫乔基姆·安德森租借加盟富勒姆，租期一个赛季。2021年3月19日，乔基姆·安德森在富勒姆主场1-2不敌利兹联的英超比赛中打进了效力富勒姆的首粒进球。2021年6月底租借到期归队。

　　2021年7月28日，乔基姆·安德森从里昂转会加盟水晶宫，转会费为1750万欧元。

　　国家队

　　2021年5月，乔基姆·安德森入选丹麦国家队出征2020欧洲杯26人大名单。